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加权基因共表达网络构建(Weighted Gene Co-Expression Network Analysis, WGCNA)是一种从高通量数据中挖掘模块(module)信息的算法。在该方法中module被定义为一组具有类似表达谱的基因,如果某些基因在一个生理过程或不同组织中总是具有相类似的表达变化,那么我们有理由认为这些基因在功能上是相关的,可以把他们...
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KEGG Pathway-Pathway Network
分析KEGG Pathway之间的相互作用关系,发现下上游信号通路,寻找核心通路。
前置分析条件:
必须有KEGG信息。
分析结果:
l 图片文件(Network图),包括png,PDF格式;
l Cytocape文件:可以cytoscape打开进行细节调整;
l 文本文件:Pathway degree, 每个Pathway之间具体的相互作用关系。
Demo
结果:
Demo
结果解读:
上图展示了各个显著富集的
Pathway
之间的信号调控关系。
展示的所有图表均为demo数据结果,在具体分析过程中可能出现微调,所有结果以最终报告为准。
地 址:上海浦东新区环湖西二路888号 联系电话:400-880-3241 邮 箱:
service@orizymes.com
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