1.     具有多种标记试剂,可同时对8个样品进行蛋白差异分析。
2.     该技术为体外标记,可标记各种动物组织、植物组织、微生物、血浆、体液、细胞培养物、等样本。
3.     和以凝胶为基础的定量方法比较，该技术不仅可发现胞浆蛋白，还有膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白,并可检测出低丰度蛋白、强碱性蛋白、小于10KD或大于200KD的蛋白。
4.     报告离子的相对分子质量较低(113-121)，低分子量区是质谱定性(质量确定)和定量(丰度比较)较为准确的区域，因此质谱检测更为灵敏可靠。
5.     自动化程度高：液相与质谱连用，自动化操作，分析速度快。

itraq试剂由三部分组成：报告基团、质量平衡基团和肽反应标记试剂基团，形成4种或8种相对分子质量均为145的等量异位标签。

iTRAQ试剂标记酶解后的肽段,可与氨基酸N端及赖氨酸侧链连接的胺标记同重元素(isobaric)。在质谱图中，任何一种iTRAQ试剂标记的不同样本中的同一蛋白质表现为相同的质荷比。
在串联质谱中，报告基团、质量平衡基团和多肽反应基团之间的键断裂，质量平衡基团丢失，带不同同位素标签的同一多肽产生质量为114,115,116和117Da的报告离子，根据报告离子的丰度可获得样品间相同肽段的定量信息，再经过软件处理得到蛋白质的定量信息。

整个实验分为预实验和正式实验部分，总实验周期为6周。
预实验部分包括：蛋白样品制备，蛋白定量，SDS-PAGE胶，蛋白酶解，质谱预实验，出具预实验报告。以确保蛋白和肽段样品符合正式实验的要求。
正式实验部分包括：ITRAQ标签标记，SCX色谱分级，正式实验质谱分析，数据库检索及出具正式实验报告。  

        实验原理，实验流程，实验试剂仪器，实验步骤及参数，实验结果
　　分析数据：全部检测蛋白的登录号及名称，分子量、等电点、肽段数等常规数据，蛋白定量数据及相应的p值。
　　生物信息学分析数据：统计学差异表达蛋白的GO，pathway，network分析报告
        RAW文件：质谱原始数据文件 

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