BSA(Bulked Segregant Analysis)又称混合群体分离分析法,是利用极端性状进行功能基因挖掘的一种方法。主要思想是将两个具有极端性状的群体进行混池,结合DNA测序,比较两个群体在多态位点(SNP)的Allele Frequency(AF)是否具有显著差异,找到AF具有显著差异的位点,对这些位点进行筛选,可进一步定位到目标性状相关的基因或标记。 BSR(Bulked Segregant RNA-Seq)是利用RNA-seq的结果结合混合群体分离分析法对目标性状进行定位的方法。
l 与传统图位克隆方法相比,该方法周期短,定位准,性价比高,但是对遗传设计和样本取材要求高,而且必须有基因组信息; l 攸归有专门的遗传学专家配合专业的生物信息学团队,针对不同的遗传设计搭配合适的方案; l 团队已经完成过水稻、拟南芥、小麦等物种的BSA-Seq/BSR-seq定位,具有丰富的经验和沟通技巧。
BSA-seq l DNA大于等于1ug l OD260/280为1.8-2.0 l 适用范围:有参考基因组 BSR-seq l total RNA大于等于1ug l OD260/280为1.8-2.2 ,RIN值>7 l 适用范围:有无参考基因组皆可
HiSeq4000或者XTEN, PE150
BSA-seq BSR-seq
此处为内容5
此处为内容6