l  total RNA大于等于3ug 
l  OD260/280为1.8-2.2 ，RIN值>7
l  适用范围：需要参考基因组 

 HiSeq4000或者XTEN, PE150 

l  原核转录组分析：

若需要进行sRNA分析，建议链特异性建库；
上图中展示的为常规分析的内容，部分内容需要在报告出具且与老师沟通后执行；
部分高级分析内容请点击“生物信息分析”；
定制分析请与业务人员沟通，安排合适的分析人员进行交流。
l  部分结果展示：

箱线图

相关性分析

 PCA分析

样本间聚类

样本相关性热图

火山图
Gene ontology分类图

1.       转录组测序需要多大的测序量才能足够？
    由于原核生物参考基因组比较小，基因数量少，建议测2G左右的测序量。
2.       是否需要生物学重复？重复几次？
生物学重复的设置是实验设计中一个不可或缺的部分。设置生物学重复的目的主要包括如下两个：1通过重复样品的平均值得到更准确的测量结果；2计算样品群体的方差，从统计学方法上判断两组样品质检的差异是否具有显著性。在设计实验时如果没有生物学重复或者生物学重复数量不够，就不能得到有统计意义的实验结果，获得的差异表达基因很可能仅仅是少数个体差异的表现，而不能反映群体的本质特征。所以实验中设计合理数量的生物学重复是非常重要的。
早期基于高通量测序的组学研究（如RNA-seq），可以不设置生物学重复，或通过将若干生物学重复混合为一个样本后测序的策略，来部分弥补个体差异的影响（如 BMC genomics等SCI期刊上的相关研究普遍采取这个策略）。随着测序价格不断下降，对多个生物重复样本的单独进行测序也逐渐成为高通量测序项目的趋势。一般建议至少3个生物学重复。如果仅设计2个生物学重复，在后续发文章时，很可能会因为生物学重复设置不够被编辑质疑。而且，开始没有设生物学重复或者设两个生物学重复，后续分析或者写文章的过程中发现需要补生物学重复，这种情况下，由于不是一批实验，不同批次实验材料之间误差和系统误差都会变大，结果肯定是没有同一批次做出来的结果准确和漂亮。
更多信息可以与我公司业务人员联系或者写邮件至service@orizymes.com咨询。

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